瓊脂由瓊脂糖和瓊脂果膠(Agaropectin)兩部分組成，作為膠凝劑的瓊脂糖 是不含硫酸酯(鹽)的非離子型多糖，是形成凝膠的組分，其大分子鏈鏈節(jié)在1，3苷鍵交替地相連的β-D-吡喃半乳糖殘基和3, 6-α-L-吡喃半乳糖 殘基。而瓊脂果膠 是非凝膠部分，是帶有硫酸酯(鹽)、葡萄糖醛酸 和丙酮酸醛的復(fù)雜多糖，也是商業(yè)提取中力圖去掉的部分。在工業(yè)上的瓊脂色澤由白到微黃，具有膠質(zhì)感，無(wú)氣味或有輕微的特征性氣味，瓊脂不溶于冷水，易溶于沸水，緩溶于熱水。